Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms