Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT1P26358 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms