Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms