Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGB6P18564 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms