Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI2P10070 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI2P10070 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLI2P10070 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI2P10070 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI2P10070 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms