Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4BP0C0L5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4BP0C0L5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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