Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALB1P05937 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms