Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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