Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms