Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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