Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA2O43364 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA2O43364 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms