Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSI1O43347 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms