Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms