Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DGG1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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B4DGG1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DGG1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DGG1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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