Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms