Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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LINC00587B1AMM8 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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LINC00587B1AMM8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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LINC00587B1AMM8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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LINC00587B1AMM8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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