Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms