Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms