Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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