Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC12A4Q9UP95 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms