Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCML1Q9UN30 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms