Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms