Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms