Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms