Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP35Q9P2H5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP35Q9P2H5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP35Q9P2H5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP35Q9P2H5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP35Q9P2H5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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