Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRBP1Q9P2E9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms