Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms