Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NYXQ9GZU5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NYXQ9GZU5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms