Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms