Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms