Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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