Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms