Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NMD3Q96D46 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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NMD3Q96D46 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NMD3Q96D46 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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