Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms