Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms