Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms