Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms