Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCL2Q8N4E4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms