Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms