Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms