Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q6P435 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6P435 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6P435 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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