Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR44Q5JSH3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms