Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms