Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms