Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms