Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms