Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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