Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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