Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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