Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
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NCOA1Q15788 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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NCOA1Q15788 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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